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痕量分析的水質實驗室其室內環境質量直接關系到實驗數據的可靠性。在ISO/IEC 17025《檢測和校準實驗室能力的通用要求》中，對實驗室凈化的環境條件提出了明確的要求:“實驗室應確保其環境條件不會使結果無效或對所要求的測量質量產生不良影響。”對痕量分析的水質實驗室而言，影響室內環境質量的主要參數是潔凈度、溫度、濕度等。

據了解，在工業城市（污染地區），即使在沿海和農村地區（清潔地區），大氣中的灰塵數量也可以達到3×105/L（≥0.5μm），大氣中的塵埃數也可達到1×105個/L(≥0.5μm)。實驗室凈化中，環境空氣中含有大量的懸浮微粒，其中均含有銅、鉛、鋅、錫、鉻、鎳、鋇、釩鈷等元素，有資料介紹其含量可達0.1μg/m2。一般敞開的室內每天接受降塵20μg/cm2，密閉的室內每天可接受降塵10μg/cm2。

因此，當樣品的溶解，蒸發，灰化等操作花費很長時間時，它可能被空氣污染。或者污染分析器具或者污染樣品或者增加分析空白，嚴重影響分析質量。并且，實驗室凈化空氣中還含有大量的細菌和霉菌，潮濕的灰塵沉積或擴散于精密儀器內，便使儀器內的電光元件發霉，影響分析儀器性能，縮短儀器使用壽命。因此，對于檢測ppb級甚至于ppt級含量水質實驗室而言，實驗室內空氣質量影響水質分析的問題應引起高度重視。

目前，在痕量分析實驗室凈化中尚無遵循提高空氣清潔度要求的標準。電子行業或制藥行業通常被用作參考。比較而言，根據目前水質分析儀器的檢出限水平和水質標準各檢測指標的濃度限值，以及當地空氣環境質量狀況來確定是否實施空氣凈化及其潔凈度級別。一般來說，實驗室凈化中，理化分析達到十萬級便能滿足要求，微生物檢測需更嚴格一點。

水質實驗室試圖在實驗區進行空氣凈化改革，并根據不同的測試項目將清潔區分為四個等級。凈化工程中的理化項目實驗區均設置成10萬級(105個/ft3，≥0.5μm)的空氣潔凈度;細菌及大腸菌等微生物實驗的準備區設為10萬級，準備區到檢測區的過渡區設為萬級(104個/ft3，≥0.5μm)，檢測區設為千級，實驗室凈化的檢測區內的操作面設為百級。從凈化系統運行前后的室內環境質量看，效果是明顯的。